外链工具 tbtools热图工具栏介绍?

发布于 2022-04-12 02:47:31
标签: 外链工具 tbtools热图工具栏介绍?外链工具tbtools热图工具栏
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序列处理工具

在组学数据分析中,一个常见的问题是,如果基于给定的基因列表,从序列集合中提取序列这一功能,不仅可以用于提取基因的全序列,也可以基于用户指定的染色体区间,批量提取对应的区间序列。当然,只要起始坐标大于终止坐标,用户可以直接获得正链的反向互补序列,事实上即反链5-3的序列。

查看序列文件中的序列个数,获得其中所有序列的ID和统计信息,有时候会有不少用户,尤其是做进化分析的朋友,Fasta Stater这一功能可以帮助用户快速统计Fasta文件中每个序列的信息,包括ID,长度,描述信息,GC含量等。

Blast相关的界面化工具

无论是早年低通量的分子生物学时代,还是现在高通量测序普及的状态,local blast总是存在需求的。相应的,也有不少工具其实有本地blast的界面接口,其中包括BlastStation,BioEdit等。当然,TBtools也有,我自认为TBtools的操作会简便很多,相比于其他工具。

基因功能分析工具

组学数据分析中,我们总是可以获得一些基因列表,如差异表达基因,进化过程中的正选择基因,缺失的基因等。快速了解这些基因是否明显偏好于某一功能,如成花?低温响应?转录调控?基因的功能富集分析,是一个常见的操作。TBtools中提供基于超几何分布的富集分析操作,包括GO富集分析和KEGG通路富集分析。

图形可视化工具

前前后后,基于个人追求,独立于TBtools,也独立于EasyCodeML,我有一业余项目,即写了绘图引擎,目前已经重写至少两次。(注意,我只是命名偏好于类似大家说的R语言的ggplot2,但跟ggplot2没啥关系,这就像TBtools早期叫BioCJava,跟Biojava一点关系没有是一个道理的。

JJplot -> JJplot2 -> JIGplot

有了绘图引擎,那么可以做很多事情就更多了。将其应用于TBtools中,我们获得目前多数TBtools的数据可视化功能。

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1、首先打开网商图片下载工具,点击上方的工具,选择要下载的相册平台


2、我们选择又拍相册为例子,复制要下载的相册链接到软件框内,然后点击分析相册


3、我们勾选要下载的类目,要添加图片水印可以点击添加水印,然后点击立即下载


4、我们打开文件夹来看看效果


是不是很简单呢,你也来试试吧!

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